Неожиданное разнообразие вирусных последовательностей в геноме человека

Три генетика RIKEN обнаружили ранее необнаруженные фрагменты генетического материала вирусов, скрывающихся в ДНК. Методы, которые они разработали для этого открытия, будут полезны для определения того, когда этот вирусный генетический материал вошел в геном человека, а также может ли он вызвать различия между людьми.

Неожиданное разнообразие вирусных последовательностей в геноме человека

Кодзима, Ансельмо Камада и Николас Пэрриш из RIKEN IMS исследовали вариации на основе вирусов у 3332 человек из различных групп населения, используя биоинформатические инструменты, специально разработанные для этой задачи.

Они обнаружили, что вирусы ответственны за неожиданные структурные изменения в геноме человека. Они также обнаружили редкие варианты в зародышевой линии, которые можно проследить до вируса герпеса человека.

Однако не весь вирусный генетический материал, который они обнаружили, имеет древнее происхождение. Трио обнаружило, что некоторые обычно используемые клеточные линии были заражены вирусами. «Мы думаем, что эти последовательности, вероятно, вызваны инфекцией человека, сдавшего свою кровь для генетических исследований человека», — говорит Пэрриш. «Как ни странно, вирусы обычно не заражают В-клетки, которые использовались для создания клеточных линий, которые мы использовали, и поэтому мы не до конца понимаем, как эти вирусы инфицировали клетки».

Команда намеревается изучить возможные функции идентифицированных последовательностей. Некоторые исследования предполагают связь между вирусными генетическими последовательностями и более высоким риском определенных заболеваний, отмечает Пэрриш.

Источник — 1nsk.ru.

1nsk